作为枪战手游，魂斗罗归来中武器种类繁多。游戏以武器系统为核心，根据武器的强弱，分为不同的星级和等级。要想在魂斗罗的世界里纵横四海，首要的任务就是挑选出适合自己的最强武器。
当前版本的武器重，最高品质的是A级，最高星级为4星，其次是3星，这些也是玩家主要使用的武器，所以这里也只分析这些武器。
宝钗分，桃叶渡，烟柳暗南浦。
最强武器：
加特林，极速连发射击的重武器，造成攻击力8.5%的伤害。
目前游戏中唯一的A级4星的武器，是一把主武器。但其实也只是再初始的时候会强一点，因为所有的A级武器都是可以升星到最高的3个月亮的。从游戏中也可以看出，加特林的初始攻击比其他的A级武器都高48点，穿透、命中、暴击则都是一样的。不过射速倒是非常的高。
其他三星武器：
其他的A级三星武器攻击、穿透、命中和暴击的初始属性都是一样的，主要区别在于特性和弹幕，谁强谁弱还是要看用在什么地方。
主武器：
AKX突击步枪，快速射击，造成攻击力10%的伤害;
L-7辐射步枪，高能激光步枪，命中目标后散射攻击多个目标，造成攻击力8%的伤害;
副武器：
粉碎者火箭炮，远程范围爆炸性武器，可同时对4个目标造成攻击力271.4%的伤害;
烈焰守护者，用高能火焰喷射敌方，造成攻击力132.7%的伤害，并附带持续灼烧效果;
EX蓄能激光炮，弹幕为短暂蓄能之后释放超高能激光柱，造成攻击力84.7%的多段范围伤害;
等离子喷射枪，近距离范围攻击武器，可击退敌人并造成攻击力192.6%的伤害;
爆裂火焰枪，发射等离子爆裂弹，造成攻击力162.8%的伤害，并溅射伤害周围目标;
暴风雪，高压液氮喷射武器，近距离大范围对目标减速，并造成攻击70.8%的伤害。
JS-166狙击枪，超远距离射击，可穿透多个敌人，造成攻击力221.5%的伤害。
投掷武器：
G7改良手雷，投掷武器，爆炸后可同时对5个目标造成攻击力271.4%的伤害。
G7改良电磁雷，高压电磁手雷，可使目标短暂麻痹，并造成攻击力226.2%的伤害。
从上面可以看到不同武器的弹幕效果都是不一样的，大范围伤害的，攻击多个敌人的可能在刷图武器上就可以排前面，快速射击的那把突击步枪，在竞技中效果应该更好。总之还是要看用在什么地方。
注：当前游戏中所有A级枪支最高都可以升星到3个月亮，满级火力都是一样的31172。