军团后勤的主要职能是为军团打造强大的物质基础：在非战时通过成员向军团输血来囤积战备物资，并在战时通过军团向成员的反向输血来确保战争的最终胜利。
相比个人后勤系统，军团的后勤体系更为复杂且需要军团成员通力合作才能发挥出最大效能，所以本文将首先介绍军团后勤系统中与个人关系最大的3个功能：军团仓库、军备订单和战损申报。
军团仓库
军团仓库的入口位于空间站内军团功能的主页，并可以分为“数字账户”和“实物仓库”两部分：其中数字账户记录的是军团钱包的余额，而实物仓库则会分门别类地规整军团所拥有的实物道具：
美人依约在西厢，只恐暗中迷路，认余香。
军团联储币是军团拥有的主要货币，其主要来源之一是军团成员的每日捐献：军团成员每日可以向军团捐献最多1,000,000联储币，被捐献的联储币将转化为军团联储币进入军团账户，同时军团会返还1,000,000军团奖励点给成员，军团奖励点是军团玩法专属的特殊货币，可以在奖励点商店中购买限购的物资。
除了依靠成员捐献，军团从中期开始还可以通过军团贸易玩法出售军团主权星系内产出的军团矿物来赚取巨额的军团联储币，此部分内容已在军团玩法的主题攻略中详细介绍过。
军团实物仓库的分类和玩家个人仓库非常类似，其主要堆放的是军团通过军备订单向成员买来的常规舰船和常规装备。除此之外，军团实物仓库还有两个特殊的大类：设施和旗舰，其中堆放的是只能通过军团生产建造的太空建筑和军团旗舰。
军备订单
军备订单可以理解为一个基于军团内部的供销市场，其主要目的是：将军团成员个人后勤系统的产出内容导向军团的标准会战配置，并利用非战时在军团仓库中囤积足够的常规战略储备，以备在战争开始后有足够的备用舰船和装备为军团成员进行补损。
拥有相关权限的军团管理可以在停机坪中通过已储存的配置按套发布收购需求，或是在军团收购功能的编辑模式中手动发布收购订单：
在生成收购订单时，订单的价格是根据所选道具昨日在交易行的平均成交价自动标定的，这个价格无法进行人为修改：
之后，根据军团已经发布的订单，军团成员就可以自行选择通过虫洞、开发或去声望商店换购对应的蓝图，再将它们生产成成品并出售给军团：
在军备订单中出售道具的流程和在信用点商店出售道具类似，且玩家在出售成功后可以立刻拿到由军团账户转来的联储币，而不必和交易行一样需要等待4个小时才能拿到货款。
战损申报
爆船可以理解为游戏中的死亡惩罚，且这个死亡惩罚还相当严重：当玩家爆船时，他会损失掉这艘舰船以及船上的所有装备和货柜里的所有货物。但事实上游戏并不希望玩家会因为爆船而失去继续玩下去的信心，所以针对游戏中仅有的两种爆船形式，分别有两种转嫁损失的方式。
首先针对被NPC击毁的爆船类型，玩家可以通过购买开拓者证书来获得每日2次免费的舰船复原机会，或直接使用复原协议将损失的舰船复原：
但复原协议只能修复PVE造成的损失，所以当因为PVP遭受损失时，已经加入军团的玩家还可以将自己在加入军团后的战损发布到军团，申请由军团来补偿自己的损失：
玩家可以在军团的战损申报功能中查到所有正在进行中的补损申请，拥有相关权限的军团管理可以通过军团补损来转移军团仓库中存放的同型装备，玩家之间也可以相互进行捐赠，以获得比捐出装备价值高一倍的军团奖励点：
当补损申请发布后就会进入72小时的有效期，在此期间补损申请者必须确保自己的个人基地位于军团驻地或军团主权范围内。补损申请在补损完毕或有效期结束后将自动关闭且无法再次发布。
总结：
军团仓库、军备订单和战损申报是军团后勤系统里和个体成员关系最密切的3个系统：
通过军团仓库玩家每天可以向军团捐献1,000,000联储币并获得等额的奖励点；通过汇集这些捐款军团可以根据会战配置向成员发布军备收购订单；根据这些订单军团成员可以调整自身后勤系统的产出来满足军团的需求并同时换取联储币；最终这些来自军团成员的物资又会通过战损申报系统流回在战争中遭受损失的军团成员手中。