《神怒》中的副本系统可以说是集经验、金钱、道具产出为一体的最佳出产地，而且油耗分门别类，传送，是大家升级、获取各种稀有材料都可以获得。
副本系统
界面上方的副本即可快速传送至任意副本，副本根据产出物不同，分为金钱、经验、道具三类。
曰：两美其必合兮，孰信修而慕之？思九州之博大兮，岂惟是其有女？曰：勉远逝而无狐疑兮，孰求美而释女？何所独无芳草兮，尔何怀乎故宇？世幽昧以昡曜兮，孰云察余之善恶？民好恶其不同兮，惟此党人其独异！户服艾以盈要兮，谓幽兰其不可佩。
经验副本包含剧情副本、经验副本（光明试炼）两种，其中剧情副本是根据剧情和等级的推进来进行的，不可重复。经验副本全天开启，根据VIP等级不同可挑战的次数也不同。两个副本都可以产出大量经验。
金钱副本目前只开放了一种，天岚物资，通关即可获得大量的金币。每日可以挑战2次，也可以使用免做卡快速完成。
道具副本包含神器镇魔、英雄圣殿、圣山之巅、上古遗迹、骑士之路、圣山狩猎、上古熔炉等副本。不同的副本对应其系统掉落不同的道具。
每日完成以上副本还可以获得活跃值，达到不同的活跃值可以领取活跃宝箱，如果时间不够用，也可以通过扫荡来快速实现目标。