打通这个游戏就觉得不简单，在阅读了国外玩家的很多帖子和Bioshock wiki后，这部作品的前情铺垫基本琢磨出来了。现在发出来和大家交流。因为游戏的世界观是多重宇宙，平行世界，所以严格意义上来讲并不存在所谓的时间先后顺序，这个整理只是把因果的顺序写了一遍。下文出现的年代除非特别注明，否则都是指Comstock的主世界。
Booker Dewitt（主角）是一个参加过美国内战的军人，在军旅生涯结束后，他对自己血腥的过去充满了愧疚（1890年的Wounded Knee屠杀）。于是他来到某地的河边（结局的场景）接受洗礼，改名成为Zachary Hale Comstock（游戏里面的先知，反派），企图重头来过。新的Comstock对信仰充满热情，但却很偏激。之后Comstock遇到了女物理学家Rosalind Lutece（游戏里面神叨叨的一男一女中的女方），在她划时代研究的帮助下，Comstock可以做到两件事：1让物体永久浮空，2通过时空裂缝直接观测未来从而未卜先知。之后，Comstock宣称自己受到一位名叫Columbia的大天使的启示，要他去建造一座浮空的城市。通过各种手段和未卜先知的能力，Comstock成功游说了美国国会提供建造天空城的预算。在1893年芝加哥世界博览会（Chicago Worlds Fair)上，Comstock的天空城计划首次公开亮相，举世瞩目。他借此机会开始鼓吹“美国例外论”（American exceptionalism），认为美国和别的国家不同，有着特殊而神圣的使命，而受大天使启示建造的天空城Columbia则正是这种理想的象征。在天空城建造开始后的数年间，由于受到Lutece开发的科技的损害，Comstock失去了生育能力并且急速衰老（游戏里Comstock和Booker年纪应该是一样的，但是由于前者受到实验或者穿越的影响，显得老很多）。想要生育却无能为力的Comstock为了给自己找到合适的接班人，与Lutece策划了一个计谋。
他们在观测了各种平行宇宙之后，发现在某个特殊的平行世界中Booker没有受洗成为Comstock，他在退役之后做起了侦探生意并育有一女，取名叫Annabel（Booker的妻子在生产时死去，时间为平行世界的1892年）。可惜的是，这个宇宙里的Booker由于赌博，债台高筑，甚至没钱到要卖女儿的地步。于是女版的Lutece通过量子通信，向那个世界的自已发摩斯电码，告知他（男Llutece，Robert Lutece）还有另外一个自己，引发让他们二人组相见的兴趣，并且让他按照Comstock的指示去找Booker买女儿。被逼无路的Booker卖掉了他的女儿，但很快就后悔了。当男版的Lutece要带着Annabel通过时空裂缝去另一个世界时，Booker追赶到了现场想要夺回女儿。但Booker最终失败，并且让女儿的小指被关闭的时空裂缝所断。失去女儿的Booker自此精神失常，生活在无穷的自责和愧疚当中，还在手背上刻下了AD两字（Annabel Dewitt）。
另一方面，由于时空裂缝的影响，Booker的女儿获得了神奇的穿越能力。为了更好地研究利用，并防范被预知到的False Shepard（Comstock究竟预测到了未来Lutece的背叛，还是模糊地意识到会有人来夺取他的女儿就不清楚了），Comstock把Annabel改名为Elisabeth并关进天使巨像（Monument Island）中，派songbird（巨型鸟人）看守，自己则通过特定的音符控制songbird。得到继承人后的Comstock春风得意，天空城建造顺利，基于Elisabeth的研究也让他掌握了领先世界的各种技术。1900年，天空城竣工，开始了环球巡游。1901年，飘游到北京的天空城被卷入了当时的义和团运动（Boxer Rebellion）。认为义和团亵渎了美国理想，更亵渎了上帝的Comstock下令向中国人开炮。天空城于是第一次向世人揭露了自己的真面目：移动军事要塞。由于天空城的野心和意识形态的渐行渐远，美国决定与其决裂，天空城也消失于众人的视野之中。Comstock认为美国已经背离了他原有的精神，而新的Columbia则代表了真正的美国精神。他开始在天空城更加彻底地贯彻他的“理想”，建立一个政教合一，白人中心，政府高度集权的国家。越发膨胀的Comstock失去了理智，他不但于1903年杀掉了讨厌Elisabeth，反对自己的妻子（lady Comstock），并嫁祸给Daisy Fitzroy（Comstock妻子的黑人女仆，这也使得Fitzroy后来建立了Vox Populi这个反抗组织）；Comstock还和Lutece两人组闹翻，并杀死了他们。然而由于Lutece两人特殊的情况，他们并没有真正死去，而是一直在时空的裂缝中飘荡。
为了改变自己的命运，阻止已经走火入魔的Comstock，同时也为了赎罪（wipe out the debt），Lutece两人找上了失去女儿的Booker，开始了他们新的实验：尝试让Booker夺回Elisabeth。通过改变最初的因果，改变所有平行世界的结局。因为Comstock同样可以穿梭时空，所以他预见到了Booker会来夺取Elisabeth。于是他创造了False Shepard的预言，让整个哥伦比亚对Booker进行防范。Lutece两人的实验艰难而且漫长，他们通过不断地穿越和引导，让Booker尝试了122次。他们不断地修改包含常数（constant）和变量（variable）的因果等式，希望得到不同的结果，却都以失败告终。直到游戏里的男主出现：第123次的Booker，游戏的故事开始了（1912年）。