“深渊模式(Abyss)”，就是从《苍翼默示录：连续变换2》开始加入的单机游玩模式。玩家将选择一名角色，不断挑战更深阶层，途中还可以获得各种各样的强化特效。相较于之前的“军团模式”，“深渊模式”的耐玩度更高(印象中《罪恶装备》系列也曾收录过一个类似的模式)。
模式简介：
在开始前，玩家要选择一名出战角色。在一次挑战结束前，人物是不可以在中途更换的。选定角色后，有一次机会花费金钱在商店中购买属性强化道具和特效强化道具。需要注意的是，在最初道具都是呈封锁状态的，只有在“深渊模式”挑战过程中取得相应道具，才会在下一次挑战时开启购买选项。
“深渊模式”分为四种，按难度递增分别为100层，500层，999层和无限层。最初只能选择100层，打通前一个难度才可以依次开启后其他关卡。
“深渊模式”的战斗分为一般战和守关战两种。一般战时，随着玩家不断伤害敌人，画面右上方的阶层数(DEPTH)会不断增加。每逢阶层数达到20的倍数(20层，40层，60层……类推)时，会立即强制进入守关战。守关战不会增加层数，玩家必须消灭守关敌人才算成功。
守关战结束后，系统会随机给出5种奖励道具。一般来说，前两项为属性提升(攻击力，防御力，速度和能量槽，最大50)，第三项为特效强化道具(降低敌人属性，自身特殊能力强化等)，第四项为HP回复满、全属性提升、阶层增加或减少中的一个，第五项为赏金提升。
每逢100层的倍数，都会进入检查点。玩家能够在此时选择继续挑战(按四个键的任意一个)或者将至今为止所有赏金兑换成金钱，退出挑战(按SELECT键)。此外，任何战斗结束后，立刻按下L键，都能进行中断存档，下次能够继续挑战。
关于赏金：
每打败一名敌人，都能得到相应赏金(反映在画面左上方的REWARD)。赏金的多寡是根据玩家在战斗中的表现，以及阶层数决定的。如果成功突破有层数限制的关卡，或者在百层检查点主动退出，都能够获得和赏金数量相符的金钱。但是，假如不幸在战斗中落败，那么将不能取得赏金，但是数额会保留在你失败的那一阶层。只要下次挑战时突破该层，那么可以收回这些失落的赏金。不过需要注意，再次挑战一定要选择之前落败的关卡才可以回收赏金(比如你在999层关卡的某层落败，下次必须继续挑战999层关卡。如果选择游玩100层或500层关卡，那之前的赏金就全部没有了)，但和所选择的角色没有关系。
关于阶层：
虽然高伤害和高连击对于阶层提升都有影响，但根据个人经验，连击数与阶层的提升关系最大。因此对于拉姆达这样高连击数角色来说，阶层的提升更加容易，而老虎这样段数少威力高的角色来说爬楼就比较慢了。
从20层开始的守关战角色都是普通角色，第400层开始，第一次出现UM角色，500层第二次出现UM角色，600层第三次出现。而从660层开始，之后的所有守关战对手都变成UM形态了，难度激增。
两个特殊层：在第666层时，会乱入一只攻击力50速度50的UM形态拉格纳，击倒他后能够固定出现攻击吸血道具。在第999层，固定出现UM形态12，实力超强，对战时一定要多加小心。另一个有趣的地方是960层不会出现守关战，姑且看做是对666层乱入的弥补。
关于道具：
道具收集可以说是“深渊模式”里最花时间的部分。在1层到999层间，道具的优劣度都是呈逐步提升的，突破千层之后，道具强度开始随机，同时各角色的专属装备会出现。角色专属装备只能由相应角色购买，例如拉格纳的强化吸血，琴恩的冰冻限制解除。除了在1000层以上随机得到外，更为简单的方式是让一名角色突破100层关卡，便可以直接在商店中追加其专属装备。
对于未获得过的道具，在奖励出现时都会在后方显示“New”标记，方便玩家收集。道具只要取得，无论之后是突破还是战败，都会在结束后收录入商店中。
属性提升最高只能到50，强化道具最多只能同时装备三种。
相关奖杯：
《苍翼默示录：连续变换-扩展版》与“深渊模式”相关的奖杯共有5个：
突破100层关卡、500层关卡和999层关卡，均可以获得一个奖杯;
将角色的四项属性全部强化至50，能够解开一个奖杯;
获得过所有奖励道具，能够解开一个奖杯(最麻烦的一个)。
强力战术：
最后，推荐给大家一个近乎无敌的“深渊模式”战法。首先，需要在商店开启下列三个强化道具：Turn Unlimited(将角色变为UM模式)，Anti-DD(让对手无法使用DD超必杀)和Crimson Party(亚拉酷泥专属装备，效果为让对手永远保持烙印状态)。所选择角色自然是苍翼吉祥物亚拉酷泥同学。属性提升的话有钱就买一些，没有的话在之后的关卡里慢慢提升也行。
玩过酷泥的同学都知道加上烙印后的火力有多么恐怖，而UM版的酷泥(所召唤虫数量倍增)加上永久烙印会是个什么效果呢?在此战术下，玩家所需要做的只是让酷泥远离对手，然后开始胡乱按键召唤出一场虫子风暴吧!一般来说，不管是后期多高的AI，在恐怖的虫雨下也只有死防到底的份，稍有破绽，便会受到极大的损伤，几次就会倒下。而稍微掌握酷泥烙印连击的玩家更是能够轻易打出数百HIT数万伤害，取胜只是弹指间。只要不出现重大失误(危机时刻还有一次爆发机会可以保命)，想冲到多少层都是看你的心情了……
为什么要封印对手的DD技呢?因为在后期，敌人AI极高，还是可以在虫雨中见缝插针地祭出几次攻击的，而UM角色们强化后的DD技算得上对于我们最强力的杀招了，中上个一两次基本就无力回天了。笔者已经不记得多少次倒在UM琴恩的跳跃冰箭，UM12的突进火焰，UM棍娘的强化绿一色等招式面前了，但自从封住了他们的DD技，就再也没有死过一次。