整个游戏满满透露着阴谋和黑暗
我们先来说说几个细节：
第一个是主角等3人从护林站出来跟莉莉取得联系时，主角问这里这么乱，政付不管吗？军队不管吗，莉莉则告诉主角这里乱成一团，他们（军队）起初告诉他们应该呆在家里。
第二个是田野里的坠机，走过去竟然没有看到一具烧焦的尸体
第三个是2个幸存者在无线电里说不要相信军队
第四个是最重要的关键，谭中士要枪毙2个乱闯民宅的幸存者，后来却饶了他们两个让他们30秒跑开视线，主角随后跑过去救他们，他们告诉主角说军队抓住他们殴打一顿，然后让两个生化服的人检查他们，讨论什么感染载体之类的，那个雷格蒙女士也不像她平时的样子。。。
第五个是谭中士发现有平民在与僵尸交火，请求支援，而雷格蒙顿队长却拒绝了她的请求，然后主角跟谭中士一起去帮幸存者，最后还告诉主角说你们都属于非法侵犯私人住宅
第六个是谭中士在桥对面喊让对面开门，可是对面没有人，后来到水库发现成堆的尸体，以及混凝土墙。
梦后楼台高锁，酒醒帘幕低垂。
第一个线索我们可以推理出：
这里的居民可能无法看新闻、不能打电话只能用无线电沟通，而取而代之的是军方去跟这些幸存者联系，让他们呆在家里，在这里的所有人都以为外界甚至整个世界都是这样的。
第二个线索我们可以猜测出：也许这飞机根本就没有人在里面，只有一个开飞机的，而飞机里面有可能装的是病毒。（如果有人，飞机旁边应该会有很多烧焦的，或者是血迹等等，当然，也有可能是飞机里的人被僵尸吃掉等等，但飞机有可能是第一个携带病毒进入小镇的）
第三个说明有不少幸存者遭遇了军队并被抓走或者遭遇不幸，这恰好被那2个好运的傻瓜看到了
第四个才是关键，它简介说明了军队的目的并不是救百姓，如果是救百姓，干吗不一架直升机或者大卡车全运走？而穿白色生化服的人讨论感染载体，得出猜测这2个人可能不是医生而是科学家，他们可能是在做军队做实验。至于最后雷格蒙顿队长不想平时的样子，说明这些幸存者之前有跟军队接触并受到了“帮助”，雷格蒙顿队长之前的面孔不是现在这样冷血。
第五个：蒙格雷顿队长拒绝谭中士帮助平民的请求，这个说明军队的目的并不是救平民，大家想想，如果发生地震海啸灾难，军队会不救百姓吗？所以论证上面那个军队做实验的猜测很有可能是正确的，再者，谭中士违抗了命令，说明谭中士很可能一直被蒙自在鼓里，而那个雷格蒙队长才是真正知道真相的人。
第六个：谭中士在桥那里喊军队的人开门，由此可见谭中士是知道桥对面有人的，而至于为什么没人开门，我们可以猜测谭中士被人出卖了，而水库那些堆积密密麻麻却没有被爆头的尸体，以及混凝土墙我们可以猜测，谭中士就是被人出卖的，整个事件就是一次实验。
最后把上面6个事件综合我们得出下面这个：
一架载有病毒的客机（是否真有乘客不得知）被准确地坠毁在这座城市，同时这个城市的电视、电话打不通，只能用无线电内部联系，无法与外界联系，只能与军队联系，而军队起初告诉市长及居民外面也乱作一团，让他们呆在家里，然后进行了部分重要人士的撤离，但是撤离过程中市长“意外”中枪了（这是警长说的），有可能是市长被除掉了，紧接着，市民变群龙无首，这时候军方代表雷格蒙顿女士出现了，告诉市民呆在家里，接受“检查”等等，但是事情并没有变好，越来越多的人变成僵尸，所以这个检查过程可能是有问题的，也许不少人就在这个时候中了病毒变成了僵尸，而只有少部分幸存者在法院、西部工厂、存活下来。
雷格蒙顿队长以抓住放病毒的人为由，把谭中士等下属骗到各地扎营，而她自己实际上就是考察病毒发展情况，游戏里第二次玩家去见军队就是这个情况，屋子里有个女人就是雷格蒙顿队长。
谭中士发现平民与僵尸交火，说明他第一次才知道事情的严重性，而需要保护平民，雷格蒙顿队长肯定也知道了谭中士违抗了命令，她先撤离了这快地方并让谭中士驻守一段时间，等时间过了通知他到桥那里回基地，而这一走就是好久，期间包括在她水库放尸体污染水源，变异整个西北部小镇、建造混凝土墙封锁道路等。。。但是谭中士不知道，谭中士后来因为多次帮助其余幸存者（有一次他特地到主角基地跟莉莉对话，赞扬你们勇敢帮助其他人）可以看出，主角一伙人在幸存者中间声望是很高的，而其他幸存者把这个事告诉谭中士，所有谭中士才会上面找到玩家并褒奖玩家的善举。
最后谭中士身边的手下越来越少，他自己甚至也生病的（在无线电里不断咳嗽）他不得不请求支援，但雷格蒙顿队长却始终无法联系，无奈他到了桥边，才发现桥边已经没有人了，他和其他幸存者被锁在了马歇尔城。
炸开门后，他发现水库的问题，以及炸掉混凝土墙的时候牺牲，至始至终都被蒙在鼓里，而混凝土墙被炸开的那一刻，玩家看到混凝土墙外的地方也有许多尸体，我们可以猜测这些尸体里或许有雷格蒙顿队长的尸体，她刚建完混凝土墙就被她的上司给除掉了，而主角出去以后，也有可能面临着被狙击手打死的危险。