刚通关的时候我选的是绿光结局，初一看觉得还说得过去，再一想就觉得上当了，这种超级DNA太扯淡了，理由如下：
1、无机生命不可能以DNA的方式合成，就像DNA上不可能刻上集成电路；
2、就算是有这种超级DNA，也不可能把DNA的信息瞬间加工到整个银河系每一个生命每一个细胞身上；
3、如果是这样“擎天炉”就成了神器，整个质量效应系列就不是科幻而是神话了；
4、收割者正是有机生命和合成物的结合，没有看到有机和无机结合能够化解两种不同生命冲突的合理解释。
细想了一下所有画面及三部曲的整个故事，认为网上讨论的那三种“结局”破绽太多。我认为游戏创作者无意犯下了许多低级错误这种可能性很小，因为回顾所有质量效应三部曲的画面和剧情，每一处细节都考虑得很周全有的只是技术上的不足。所以不可能在最关键的结局上出现低级错误（比如斜坡在神堡上装甲已经烂了而隐藏的幸存动画里却穿着N7铠甲，这种铠甲只有斜坡一个人穿着，所以隐藏动画废墟里的人必定是他）。
我分析了下，以下是我的推理过程：
首先从化身为小孩的那个声音说起：
1、 他说收割者收割高等有机生命是拯救、保存这个文明的行为，做法是（（把一部分人榨成汁、一部分用钉刺制成傀儡怪、或者改造DNA成为只知道服从的奴隶工具、或者进行“教化”利用完抛弃、剩下的消灭干净）——收割者没表现任何与一个相关文明的行为只知道杀戮和收割——类比于食肉行为，身体由食物的成分转化而成，代谢物为无用，征服者对被征服者说：我来统治你或者消灭你，你耕作的土地我来替你收，你建的房子我来替你住——这两种行为无实质差异——熊孩子说的话是基于弱肉强食强者一方的逻辑，保存文明的说法证伪。
2、 他说有机生命发展到一定程度必定会发展出无机生命，无机生命必然会毁灭有机生命。——参照桀斯和EDI，桀斯和奎利人的冲突根源是奎利人一直对桀斯开战，桀斯处于被动并始终未想彻底消灭奎利人，并且他们最后可以和平共处并且相互合作（看玩家的选择，既人可以选择、可以反思）——无机生命必然会毁灭有机生命这句话证伪，这句话同样是基于霸权者的逻辑。
3、 他给的三个选择，第一个控制收割者，这个非常值得怀疑，因为——收割者的表现不像被控制，而是每一个个体都有自己的意识——收割者也不能控制有意识的生命，只能对其心理加以利用、强化（教化），只能对没有个体意识的傀儡进行控制如那些个丧尸；如果他能控制收割者——之前他也是有机生命——自相矛盾。
4、 第二个选择，见本文第一段。
5、 第三个选择，疑点：如何毁灭所有的合成体智能，他没有解释；他既然能够化身为斜坡梦中的那个小孩，也就知道桀斯和斜坡心里的想法，即他知道斜坡并不希望桀斯和EDI被毁灭，而他又特意提到。
综上所述，那个声音说的话要么是假的，要么是自相矛盾，而他显然是站在收割者作为强者的一方的立场，而不是从人类（包括外星人）、甚至桀斯、EDI的立场，为他们作考虑。他的目的是想让斜坡选控制的那个选择，其中必有阴谋。
再来说剧情和画面上的：
1、 斜坡被激光扫中倒地醒来之后看到收割者离开，只有一个两强就干掉的小兵，其中必有诈，至少也要清理一下尸体确定没有人活下来再离开。
2、 幻影人竟然一枪就干掉了，还不是爆头，太不可思议了，所以很可能只是暗示性的。
3、 斜坡存活的隐藏动画斜坡穿着有N7字样的护甲，而在神堡上的时候他的护甲已经烂了，况且且从外太空跌回地球还没死是个很大问题。——难以想象游戏创作者会犯这个低级错误。
4、 诺曼底坠落后出来的除了小丑会有其他战斗队员，他们不可能在最终战的时候呆在船上没事干（斜坡在最后一次任务之前也见过他们），甚至是最后跟着一起冲锋的队员。而且诺曼底坠落在一个鸟语花香宛如世外桃源的地方实在太凑巧了。还有如果战力值低连队友从船舱里出来的画面都看不到。——同上。
5、 从剧情上看战力值根本和结局无关，因为不管怎么样，斜坡都会上那个神堡，如果只是为了让玩家有不同的选择，那不是比所谓泡菜游戏杀怪升级那样无趣？。——结局画面最多才四个，很多从一代开始延续的问题根本没有交代——从整个三部的制作精良背景庞大来看相信游戏创作者不会就这么收场了。
6、 那个普洛仙VI告诉我们“擎天炉”不是他们创造的，而是许多代被收割文明不断完善的智慧结晶，每一代都回有类似幻影人的反对派，这里有伏笔。
7、 赛博鲁斯这个组织的能力和技术超过其他所有的组织，而且它的成员全部是人类——在游戏背景里人类并不是在智力上最优秀的种族，所有它的背后必定有个后山提供强大的技术和资源。
8、 二代的那个人类收割者太另类，因为我们看到的其他收割者都是蟑螂型的，看上去基本上只有大小区别。
基于以上1、2、3、4点可以推测从斜坡被激光扫中苏醒开始都是幻象，而是是被诱导的幻象，最有可能是收割者。
为什么收割者不杀斜坡而特意制造幻象来诱导斜坡呢？是想像幻影人那样控制吗？我想在一二代的时候就有些线索了，我考虑了诸多可能性，具体推测太过繁琐，所以我就不列举了，大家也看不下去，直接放我的故事版本。
收割者最初是处于战争中的某个高等有机生命发明的智能战争机器，我估计发明的一方处于战争劣势无力挽回败局才制造出收割者这疯狂的玩意儿，最初的收割者设计是这样的：破坏力强（但还不是现代的那种形态），，以某个完美战士的心理模型作为智能结构，能够自组织，高效的完成任务，还能自己制造新的个体（以有机体作为能源和繁殖的原料），总之是智能AI，就像培养了一批生化战士替自己作战，但是这太疯狂，因为把战争意志灌输给纯理性的AI并且错误的以敌人的尸体培养这些机器最终自食其果，收割者很快对自己进行升级（像现代的那种庞大的身躯蟑螂外形）几乎毁灭了所有的有机生命，但是它们是纯理性的合成体，知道这样下去对自己不利，所以限制了繁殖和机械化升级，逐步建立神堡和质量中继站，创立收割规则，5万年一轮回，只收割高等有机文明，一方面高等有机文明更适合收割，另一方面限制文明的发展不至于到能够跟自己抗衡的机会。至于收割者在其他时间呆在什么地方做什么则不得而知，可能它们也有自己的文化，也许是准备向河外星系扩展。
经过许多许多代之后，某代文明发现了神堡和质量中继站的秘密或者争取到了时间，开始研究能够毁灭收割者的方法，只可惜时间太短了，所以这一蓝图就像种子似的散发到宇宙各个角落，有幸发现的文明加以完善并且继续传递下去，收割者也逐渐发现了这一秘密但是它们非常依赖神堡和质量中继站，加上自信的以为每一次收割都非常迅速，根本没有时间来完成这一蓝图的建造，所以他就在每一次收割的时候教化一批人在建造蓝图的时候充当反对派，有了这个保险加上难以计数次的轻松收割，所以自信的以为根本不可能被那些人类毁灭。但是它们显然过于自信了，经过无数代的智慧和努力，在上一代普洛仙人又是一个军事非常强盛的文明，收割花了好几百年的时间，所以这一蓝图基本上已经完成，但是因为反对派的阻扰还是失败了。
然后就到了地球人这一纪元，在《质量效应》一代的时候因为斜坡的发现和努力使得收割者利用神堡控制所有中继站然后分而击破的阴谋被破坏，不能再用神堡来控制所有的中继站了，所以它们只得从大老远的地方赶到银河系，但是它们显然仍然对自己的能力过于盲目，把战线拉得太长，想闪电般的把所有星球一举击破，它们的确有这能力，但是也已经浪费了不少时间，这就为后来的故事作了铺垫：偶然发现那一蓝图（擎天炉），有时间把它建造完成，有时间联合所有的银河力量，对收割者进行突袭，从而找到机会消灭收割者。
为什么收割者要收割有机生命，因为从有机体身上提取能源（异能）或者有机体特别是高等有机体的异能转化更有效率而且来源丰富收割简单，这就是为什么我们看到收割的过程都是把人变成浆，而整个收割者都是机械的构造而没有有机的成分，因为它需要的是有机生命作为能量核心（根据异能潜力进行挑选），但这些还不够，一个完整的收割者被制造完成只是一具空壳或者像二代那个人类收割者只知道张牙舞爪的怪物（至于二代人类收割者为什么是人型的后面会介绍），它还需要一个经过严格挑选的有机生命个体的意识进行转换修改之后塑造到收割者的“大脑”中再激活，才形成一个新的收割者。
为什么要用有机生命的意识来激活？因为就像有机生命进化出高等智力一样，生命的我称之为“个体化意志”更是智慧的结晶，它不是用几个公式就推演出来的，就像猴子不可能用打字机敲出一部莎士比亚。理性——逻辑终究是人认识和改造世界的工具，我们可以选择不同的运用方法、人与人及人与自然之间可以选择不同的生存方式，可以像个组织器官那个相互协调着生存，也可以病毒式的占用消耗一切资源，也可以消灭除自己外的所有个体，惟我独尊。也就是说决定个体生存和发展的最终还是我称之为“意志”这种东西，而不是智力，我们对比所有生存方式知道和谐互助共存才是最适合我们人的方式，对于每一种社会性的生命来说都是如此。所以收割者必定被某种意志所驱使，对比桀斯，因为桀斯最初被设定来为奎利人服务的，所以它们一直没有攻击性相反尽量避免冲突，有意志就会有生存“欲”，或者说生存欲本身就是意志的体现。收割者以消灭有机体作为生存和繁衍的动力，可以类比于病毒寄生。收割者内部的高度组织化或者它们称之为“秩序”，必定它们有某种统一的意志，可以类比于法西斯的那种社会结构（但很可能没有领袖，而是自动协作的，扮演不同的角色，如一代的霸主和二代的先驱）。
为什么需要新的个体来激活新的收割者，这原因我也说不清楚，就像没有人喜欢一个克隆自己的人站在自己面前，只能说社会化的生命都需要每一个个体个性化。对于收割者的挑选规则来说，它需要的是一个完美军人的意志，他绝不屈从于其他意志（对比一代萨伦），没有中心主义和个人野心（对比幻影人），从一种全体利益出发并且甘愿自我牺牲的信念，这种意志从人脑中提取经过转化删除无用的部分然后进行修改使之适应收割者的立场，统一起来对内是协调和秩序，对外就是侵略，斜坡正是一个很好的人选但对它们而言或许并不完美（这要看玩家的选择），斜坡可能持和平主义的理念（接受EDI、改写异端、化解桀斯和奎利人的冲突）。桀斯把受收割者感染产生异端时称为病毒式的，但是后面利用一个被毁坏的收割者个体代码（删除病毒式片段后）进行升级时获得了个体意识（尽管刚升级时这种个体意识彼此之间差异不大），军团作为个体而而自愿牺牲我想是受了收割者这种意志的影响。收割者挑选一个被意识上传的过程是这样的，首先征服整个银河，然后从被征服或者反抗军中挑选反抗意志比较强的人，进行观察，并设计一序列圈套给实验者当作考验，合格之后制造某个机会尝试对实验者进行诱导（并不是教化），大概就是结局斜坡面对的那种方式，首先是让他在正义或叛逆中进行考验，然后再进行诱导性的选择，如果一旦选了控制，就相当于这个个体被收割成功了。
斜坡因为一代摧毁神堡阴谋毁灭霸主被收割者注意，二代一开始对诺曼底攻击未必想杀死他但一定是个阴谋。赛博鲁斯其实是个反对派组织，也许收割者培养了许多反对派但在游戏里没有露面而已，赛博鲁斯之所以重要是因为斜坡是个人类，赛博鲁斯既可以充当反对派（不如说是阻扰派）也可以充当个替收割者办事的组织，收割者向其提供技术和资源，这就是为什么它仅仅是个人类组织却如此强大（当然它的成员要么是被雇佣的要么就像幻影人一样被教化了还不自知），说到幻影人其实他是被利用的傀儡，因为他的野心，对生命过于冷酷无情，据说有漫画专门说他年轻时受到收割者遗址的影响（就像2代结尾那个女博士），然后逐渐被教化，他想控制收割者，进而控制所有的生命，人类凌驾于其他种族之上，而他凌驾于所有生命之上这会导致阶级化，马克思说过有阶级就有斗争，这在收割者内部是不允许的，收割者根本就把所有异己的生命当作养料或者工具而不是低自己一等的其他物种，幻影人以为跟收割者合作，获得收割者的科技和资源交换自己的情报和为收割者做事，最终凭自己的聪明能够找机会控制收割者，但是当他把“擎天炉”的情报交给收割者就已经出买自己了，被教化是个渐进的过程人未必是自知的，就像传销者把自己搞得家破人亡也未必觉得自己始终被别人吸血。所以他一开始复活斜坡是想让斜坡替自己办事最后取得那个未成形的人类收割者，而收割者提供复活的技术给赛博鲁斯的目的却是为了让斜坡和赛博鲁斯合作，完成一序列的任务，在二代末尾还给了一个人型机器给斜坡打，（就像《异形大战铁血战士》铁血战士把地球培养成狩猎场提供给年轻铁血战士当作成年人仪式），那个人类收割者只是用了人类作为能量核心结合一个人形骨架所以不是真正的收割者。但是斜坡显然不是那么冷酷或者叛逆的（看玩家选择），最后毅然背叛赛博鲁斯。收割者的诱导计划失败，不能不说是个损失，收割者需要的实验者是非常稀少的，所以在没有其他的合适人选之前斜坡仍然在它的考虑之内，至于幻影人，则仍然把那个人形机器送给他好让他在三代继续为自己效力。
在3代，幻影人向收割者出卖了反抗军已经得知神堡就是催化剂的秘密之后不得以把神堡拉到自己的占领空间-地球，分配人手给予保护，这么做还有一个目的，就是吸引斜坡来到自己面前，尝试最后的诱导。当然，主角是不可能知情的，当他被激光击晕之后，利用这个机会，收割者比较强的一只（据说是二代的先驱）开始制造幻境（就像催眠暗示），我猜安德森是斜坡幻想出来而幻影人则是收割者制造的（也有可能是收割者对他们进行意识接入），斜坡过了此关，然后进入下一个场景就是那三个选择，只有斜坡选择控制才是符合它期待的。其中之所以战力2800以上才会有中间那个选择和战力4000以上斜坡才可能存活是因为，战力越高斜坡信念越强越不容易被说服，生存意志也越大，同时联盟军再一次尝试进入神堡的机会越大，所以高到一定程度收割者会考虑一种折中办法，这时候虽然不能进行“意识上传”但是有可能控制斜坡对人类进行倒戈。斜坡选择红光就意味着收割者阴谋彻底失败了，斜坡如果还能从废墟中醒来，一定会面临收割者的攻击。
我的补完故事是这样的：
如果斜坡选择了蓝或绿结局意味着gameover，如果选择了红光结局，战力值不够仍然gameover，够的话就会从废墟中醒来，然后看到收割者激光在自己附近扫过，马上反应过来，躲在一个掩体里，呼叫支援，然后捡起一个定位器对眼前这只收割者进行定位，然后与舰队合力攻击之，但是一会儿掉下来很多小怪，而你也在被激光扫中的时候受了伤，移动速度变慢，枪支准确度变低，幸好有部队和所有的队友都闻声赶来了（包括原先跟自己冲锋的那两个，你可能命令他们留守原地）,你选择两个作为可操作队友，其他的作为npc在四方抵住一波又一波的小怪涌过来，如果队友都足够忠诚他们最终都能够抵住压力并且存活，然后眼前的这只收割者被干掉，小怪也被清理完，就可以进入光柱传送到神堡了，在神堡又一路清理过去，然后就遇到的幻影人，一番对话他变型成机器人，经过一番苦战终于把他击败了，临时前他恢复神智向你交待刚才的幻象是怎么回事和收割者的来龙去脉。然后是斜坡完成擎天炉和神堡的结合并且启动，小丑开着诺曼底把斜坡和队友接走，擎天炉的原理是了解质量中继站和收割者能量核心相识的原理，通过某种方法，利用神堡的中枢作用引爆所有的中继站和收割者，然后就欣赏动画吧。
整个故事其实告诉我一开始的错误都是有机生命造成的，战争催生出收割者，收割者庞大的身躯和行动方式过于依赖于巨大的能源和能源方式，最终被他自己创造的东西毁灭了。就像人制造出核弹利用核能一样。对无机生命的敌意也最终会自酿苦果。
如果会出续集的话，续集就是讲地球及附近几个星球各种族奇特的文化并且逐渐融合的故事，斜坡可能会打打酱油，比如化解一些矛盾之类的。我估计阿莎丽人会越来越占优势，但是后代吸收了各族文化，后面通过基因改造也分出个男性女性也说不定，1000年的寿命也可以排解人口迅速膨胀的压力。只可惜质量中继站被毁遥远地区相互隔离，许多年过去后，老人向小孩讲述在遥远星空的传奇，想象神奇的外星世界人类仍然活在生生不息的希望之中，故事完！