神兽系统是《萌将》的最新上线系统，可做为玩家的坐骑，同时也可在特定活动与系统中增加属性(单挑擂台、名人堂、巨人入侵、帮会战、巅峰对决)。在游戏中神兽开启需要玩家等级达到40级以上，开放后在主界面正下方功能按钮区域中出现神兽功能按钮。
神兽被分为8阶，每阶有10星。培养神兽可以提升神兽经验，当经验达到一定值可以提升星级，升到10星后自动进阶到下一阶，培养是需要消耗灵果的。
灵果可以在商城购买或者在灵果副本内获得，灵果副本会在神兽界面内出现，按钮即可进入。
培养会有概率出现3倍、10倍、超级暴击使培养神兽获得的经验更多。
神兽同时能够进行幻化，只要神兽每进阶一次，则会开启一个新的造型，幻化需要先进行激活，激活需要消耗神兽卷轴，神兽卷轴可以在商城直接购买或者挑战灵果副本获得以及魂斗罗盘中抽取。