现在的话，明线剧情大概是科幻类的东西，一开头的医生和那个帽兜货在搞实验，通过对脑部的实验让人与人之间能通过某种方法在精神上影响对方（或者信息共享操纵记忆植入什么的）。
而主角暗线还不明了，估计后期能和明线汇合，暗线讲的是主角是个警察，对前伙伴（女的）有好感，后来跟她结婚还生了孩子，但是没有通过主角的口中有对这个有任何的表述（有可能妻儿已经gua了）。
所谓暗线我指的是从文档记录中看到的描述，明线就是过场动画了。
一.Ruvik从小喜欢解剖，研究人的大脑，他一直致力于探索如何用化学或者脑电波的方式影响脑体来共享别人的记忆和知识。引起了在精神疾病医学领域研究的一位博士的注意，博士答应免费给Ruvik一些精神病患者来供他研究，并且后面的一些文件指出不断有人因为调查病人失踪事件而失踪，推测一下这些调查者应该调查中被暴露抓起来后来做了实验致死的。过程中了解到Ruvik的实验太过血腥，于是背地里认为Ruvik太不人道，但欲望终究占了上峰，所以博士很长一段时间是Ruvik实验研究的帮凶。
二.当Ruvik的研究快要成功的时候，博士背叛了他，或许是想独吞Ruvik的研究成果，或许是背后有人高价购买研究成果（我个人倾向后者）。Ruvik警告博士，没有他，剩下的研究绝对无法完成，可是没想到的是，Ruvik的话不仅没让博士投鼠忌器，反而让博士采用了更极端的盗取研究成果的方法----取出Ruvik 的大脑，用大脑链接的方式侵入Ruvik大脑来共享盗取Ruvik的记忆，完成最终研究成果！
三.Ruvik小时候，因为农场火灾失去姐姐并且自己毁容，在他记忆里种下了愤怒，焦躁等负面情绪的种子，而随着研究人脑记忆的深入，他知道了如何在人脑中窃取记忆和利用负面情绪设下陷阱来防御他人窃取记忆，当他被博士背叛，抓住，全身麻醉送上手术台，解剖取出大脑的时候，他的愤怒，憎恨全面爆发，使用大脑的脑波在自己的记忆里部下重重陷阱，让记忆中死亡的人变成恐怖的恶灵，让自己的记忆中的通道变成了各种陷阱，目的只有一个----决不让别人共享并窃取自己记忆中储存的研究成果。
这里提一下游戏中的灯塔情节，男主看见一个好好的人被灯塔的光照了一下，就尸变了，开始攻击男主。这里的灯塔并不是指灯塔精神病院的名字，而是Ruvik在脑体被取出时，被麻醉了，看着手术台灯光，就误以为是灯塔，所以Ruvik就把灯塔强光设置到大脑记忆里，作为防御外来梦境共享者的警报开关。同理，大家注意下，Ruvik和他姐姐记忆场景里有在人脑上扎管子的解谜环节，其中提到，扎某个区域会导致人脑的剧烈疼痛。游戏中男主，眼镜男，警察司机从开篇时就是都在梦境中的，他们听到无线电里刺耳声响并且头疼，其实那不刺耳的声音不是来自无线电，而是他们现实中的身体被人扎了针，那是针的声音，而他们梦境中的头疼流鼻血则是身体的应激反应。
四.游戏中已知的，有以下几股势力：
1.Ruvik
2.博士，Leslie
3.基德曼，护士（如果主角朦胧中没看错的话）
4.男主，男主妻子，自由撰稿记者，后面的两位已经失踪了，不过在梦境里主角见到了记者。
游戏提及，博士想把Ruvik窃取卖出去，很可能是卖给基德曼一伙或者博士本来和基德曼就是一伙的，而且基德曼组织才是最大的幕后黑手。
五.游戏里有一份博士记录的研究报告，披露了共享侵入Ruvik大脑实验的全过程。他将几名昏迷的人用针管链接的方式与Ruvik的脑体链接，突然几名实验体表情异常痛苦，博士赶紧下令终止实验，可是奇怪的事情发生了，这几名参加实验的人并没有因为终止实验而醒过来，而是再也没有醒来。
六.博士的另一份研究报告，做出了解释。人脑在被共享梦境时会排斥攻击并企图同化侵入脑体中的脑电波（意念），所以链接并进入他人的大脑梦境存在很大的风险，这个风险导致博士前后实验了多次，仅醒过来了一名实验体----Leslie。虽然游戏中没有提及为什么Leslie会从前次实验中醒过来，但可以猜测一下，Leslie与Ruvik的脑电波比较接近，所以可以骗过Ruvik在梦境中的防御机制。这也是博士在乎Leslie的原因，博士希望用Leslie这把钥匙打开Ruvik大脑的意念防线，窃取到整个研究成果。现在就能解释男主在共享Ruvik梦境中，场景变换的桥段了。
七.Ruvik会用脑波直接攻击侵入实验体的意识，这个环节，实验体会头疼鼻子出血，如果实验体抵抗失败，结果就是被Ruvik脑体中的记忆梦境同化然后现实中直接脑死亡，表现出的现象为梦境中由正常人尸变成恶灵，代表人物--游戏开篇的警察司机。
Ruvik大脑的第二种手段，以灯塔形象意为信号，脑电波为手段，开启防御机制，在梦境记忆中设置各种机关陷阱，同时将记忆中的人物变为恐怖恶灵来杀死所有侵入者。
除此之外，男主和眼镜男有时听到刺耳的声响，头部剧痛，然后就会变换梦境，这种情况并不是Ruvik在用脑电波攻击链接的其他实验体，而是，现实中有人用针刺的物理化学方式刺激实验体的大脑，企图介入引导实验体在梦境中的行动。不用我多说，实施这个行为的一方就是基德曼一伙，也就是说，现实中，男主，眼镜男，警察司机正是被他们控制并用脑链接的方式链接进Ruvik的记忆梦境内。
八.一切细节性的问题也很重要，这游戏每时每刻都向我们透露制作人的真正想法，包括每一个人物的对话，就像一开始医生说：“This could not be real(这不是真的)”就告诉了我们一切都在梦境中而非现实，医生在某些方面是清醒的。
接下来在下水道遇到的那个坐轮椅死了的精神病患者的笔记其实是他的记忆，在和鲁维克连接的时候所有人遇到的陷阱应该都是差不多的，只不过有些人没有能力抵抗同化。
九.从过场动画中应该能看出基德曼是反派毫且她有着杀掉连接对象的习惯（毁尸灭迹？），无疑问，而就是朦胧中看到基德曼在旁边，后来她走了，一个人用枪将自己杀死，这个应该是遇难者的记忆。但是对主角手下留情，我们也知道至少最后主角没死，就从她说的：“you are a good man(你是个好人)“中可以看出她不忍心杀掉主角，至于主角是否最后从梦境中醒过来了还有争议，制作人可能是在为下一部留悬念。
在游戏中我们知道这些怪物都很怕火，在了解了剧情后就很容易解答，火代表着鲁维克内心中最深层次的恐惧，因为大火失去了亲人，所以这些恶灵（由鲁维克创造）和鲁维克是一样的，恐惧火焰。
在城市毁灭的时候唯有精神病院完好无损，这是因为这里存放着鲁维克的大脑，是控制中枢，也是要害所在，这些遇到的怪异常凶猛，是因为鲁维克拼命想要保护这个地方不被外人发现，所以就像主线里面表示的，在主角摧毁鲁维克大脑的一瞬间，实验就完成了，鲁维克的防线瓦解，秘密也被组织得到了。
十.至于为什么游戏里面的怪都这么恶心，我想可能是因为鲁维克内心的憎恨化作了怪物的形象，在游戏中鲁维克对医生说：*you think I am a monster*,就是说明在外人的眼中（甚至是他的父母，父亲将他关在地下室，并且禁止他母亲看望）鲁维克是一个怪物，所以他就要做出来怪物，扭曲的东西来攻击别人的精神。
十一.关于医院里的护士应该是作为一个保护者的身份来帮助主角，每当主角遇到危险时（实际是精神快要崩溃甚至是脑死亡时，护士都会提供一个温暖，安全的住处，这里又能存档，又能强化大脑机能），在整个游戏过程中护士和基德曼应该是一直都被连接着的，只不过他们可能有特殊的方法能够在一定程度上抵抗鲁维克的攻击（她们不用往大脑扎针，所以也没有流鼻血，也没有耳鸣），基德曼是执行者的身份，任务就是除掉莱斯利并且观察与监督进展情况。
以上是转自百度贴吧的内容，以下是个人对赛巴是幕后黑手的几点分析
以下是个人对赛巴是幕后黑手的几点分析
其一，为什么护士会作为赛巴的保护者而出现?为什么只有赛巴拥有强化脑波的能力（赛巴第一次见护士的时候护士说这里只有你一个人）
其二，后面的章节，赛巴昏迷时看到基德曼，随后看到一个人指枪对向自己，那个人很明显就是他自己。可能的原因是鲁本的脑世界里很多记忆是会同步的，而赛巴无意中跟这个被自己先前射杀的人记忆同步化了，所以出现了自己射杀自己的场景，实际上这是另外一名受害者的记忆
其三，赛巴的实验编号从开始的201变成后面的207又是怎样一个伏笔？
其四，如果你多次进入安全屋，护士会打趣的跟你说：“你不准备用你自己的绿色凝胶了吗？”可见护士的确是以一种接待者或者保护者的身份进入到脑世界中，而且她知道赛巴有一种让自己脑波升级的手段
很明显赛巴是有针对性的作为保护对象侵入到鲁本的记忆中去的，且在第十章的时候鲁本曾意味深长的对赛巴说：“I know who you are!" 可见鲁本对赛巴是十分在意的 这也代表了赛巴的与众不同！随之而来的问题就是作为几个为数不多的在鲁本世界中保持清醒的人之一，约瑟夫的角色是什么？
最后还有一点不知道算不算，主角在遇到这一切离奇的事之后表现的异常冷静，换做正常人早就不知所措甚至崩溃。但赛巴还能经常调侃自己，并没有任何异常反应，如果这不是制作组的失败之处（IGN点评主角很无聊）那只能说明赛巴本身对这一切早有心理准备